Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX6Q9UNH7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX6Q9UNH7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms