Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PADI4Q9UM07 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms