Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA8BQ9ULN7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA8BQ9ULN7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA8BQ9ULN7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms