Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKLN1Q9UL63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKLN1Q9UL63 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKLN1Q9UL63 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms