Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP45Q9UL16 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP45Q9UL16 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP45Q9UL16 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms