Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C3orf18Q9UK00 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf18Q9UK00 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf18Q9UK00 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms