Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCP2D1Q9UJQ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCP2D1Q9UJQ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms