Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS51Q9UID3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS51Q9UID3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS51Q9UID3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS51Q9UID3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS51Q9UID3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS51Q9UID3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS51Q9UID3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS51Q9UID3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS51Q9UID3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS51Q9UID3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS51Q9UID3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS51Q9UID3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS51Q9UID3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS51Q9UID3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS51Q9UID3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS51Q9UID3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS51Q9UID3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS51Q9UID3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS51Q9UID3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms