Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PUF60Q9UHX1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PUF60Q9UHX1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUF60Q9UHX1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUF60Q9UHX1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms