Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP25Q9UHP3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP25Q9UHP3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP25Q9UHP3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms