Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTRF1LQ9UGC7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MTRF1LQ9UGC7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRF1LQ9UGC7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms