Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXTL2Q9UBQ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXTL2Q9UBQ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms