Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMC3IPQ9P2W1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC3IPQ9P2W1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC3IPQ9P2W1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC3IPQ9P2W1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC3IPQ9P2W1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms