Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL42Q9P2K6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL42Q9P2K6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms