Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNFX1Q9P2E3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNFX1Q9P2E3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNFX1Q9P2E3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNFX1Q9P2E3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms