Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRD1Q9P1U0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRD1Q9P1U0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms