Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ABRACLQ9P1F3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRACLQ9P1F3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms