Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CHMP5Q9NZZ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP5Q9NZZ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms