Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
C9orf78Q9NZ63 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
C9orf78Q9NZ63 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
C9orf78Q9NZ63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
C9orf78Q9NZ63 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
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