Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COA4Q9NYJ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COA4Q9NYJ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms