Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 C14orf159-227ENST00000523576 860 ntTSL 317.61■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 ATG16L2-220ENST00000544490 3731 ntTSL 217.03■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 ATG16L2-203ENST00000439504 3841 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-205ENST00000517306 2294 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 RARB-203ENST00000437042 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-226ENST00000523461 2435 ntTSL 213.48□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 512.68□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 RARB-201ENST00000330688 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 RARB-207ENST00000480001 1191 ntTSL 39.32□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 RARB-202ENST00000383772 1273 ntTSL 56.99□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 RARB-206ENST00000479097 1235 ntTSL 36.72□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 RARB-205ENST00000462272 1258 ntTSL 36.39□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 EEF1B2-207ENST00000445505 515 ntTSL 521.69■■□□□ 1.068e-33■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.868e-33■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.27□□□□□ -2.218e-33■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 41.6
AATFQ9NY61 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 58.74□□□□□ -1.011e-26■■■■■ 41.3
AATFQ9NY61 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 55.83□□□□□ -1.481e-26■■■■■ 41.3
AATFQ9NY61 RPS3-220ENST00000534555 387 ntTSL 319.55■□□□□ 0.721e-323■■■■■ 41.2
AATFQ9NY61 RPS3-211ENST00000528847 639 ntTSL 512.48□□□□□ -0.411e-323■■■■■ 41.2
AATFQ9NY61 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC9.14□□□□□ -0.951e-323■■■■■ 41.2
AATFQ9NY61 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.315e-7■■■■■ 41.2
AATFQ9NY61 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.985e-7■■■■■ 41.2
AATFQ9NY61 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.835e-7■■■■■ 41.2
AATFQ9NY61 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 41.2
AATFQ9NY61 RNF126-207ENST00000605891 1671 ntTSL 537.67■■■■□ 3.623e-6■■■■■ 41
AATFQ9NY61 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.153e-6■■■■■ 41
AATFQ9NY61 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.114e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 RNF126-203ENST00000589762 963 ntTSL 231.99■■■□□ 2.713e-6■■■■■ 41
AATFQ9NY61 LINC01089-206ENST00000537157 479 ntTSL 228.14■■■□□ 2.14e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 RNF126-205ENST00000591394 733 ntTSL 227.46■■□□□ 1.993e-6■■■■■ 41
AATFQ9NY61 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.624e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 LINC01089-201ENST00000428029 1024 ntTSL 223.19■■□□□ 1.34e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 RNF126-206ENST00000592626 652 ntTSL 223.06■■□□□ 1.283e-6■■■■■ 41
AATFQ9NY61 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.014e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 LINC01089-210ENST00000543167 1059 ntTSL 221.38■■□□□ 1.014e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 RHOF-206ENST00000545544 826 ntTSL 520.2■□□□□ 0.824e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 RHOF-205ENST00000541657 1626 ntTSL 520.09■□□□□ 0.814e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 LINC01089-203ENST00000535614 480 ntTSL 419.94■□□□□ 0.784e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.774e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.594e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 LINC01089-208ENST00000541694 875 ntTSL 218.07■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 LINC01089-205ENST00000536662 560 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 LINC01089-204ENST00000535643 1014 ntTSL 1 (best)13.17□□□□□ -0.34e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.314e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 RN7SKP80-201ENST00000365188 283 ntBASIC12.61□□□□□ -0.394e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 A2M-208ENST00000497324 533 ntTSL 312.58□□□□□ -0.44e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 LINC01089-212ENST00000545885 559 ntTSL 211.46□□□□□ -0.574e-8■■■■■ 41
AATFQ9NY61 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.11e-323■■■■■ 41
AATFQ9NY61 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 40.8
AATFQ9NY61 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 40.8
AATFQ9NY61 EIF4A2-215ENST00000467585 570 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-16■■■■■ 40.8
AATFQ9NY61 EIF4A2-208ENST00000445596 600 ntTSL 215.5■□□□□ 0.072e-16■■■■■ 40.8
AATFQ9NY61 EIF4A2-227ENST00000498746 579 ntTSL 213.08□□□□□ -0.322e-16■■■■■ 40.8
AATFQ9NY61 EIF4A2-211ENST00000465222 676 ntTSL 27.83□□□□□ -1.162e-16■■■■■ 40.8
AATFQ9NY61 EIF4A2-210ENST00000465032 578 ntTSL 27.51□□□□□ -1.212e-16■■■■■ 40.8
AATFQ9NY61 EIF4A2-224ENST00000495049 576 ntTSL 27.51□□□□□ -1.212e-16■■■■■ 40.8
AATFQ9NY61 EIF4A2-212ENST00000465267 1054 ntTSL 27.51□□□□□ -1.212e-16■■■■■ 40.8
AATFQ9NY61 EIF4A2-221ENST00000491473 579 ntTSL 27.03□□□□□ -1.282e-16■■■■■ 40.8
AATFQ9NY61 EIF4A2-220ENST00000486805 590 ntTSL 23.9□□□□□ -1.792e-16■■■■■ 40.8
AATFQ9NY61 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 40.7
AATFQ9NY61 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 40.7
AATFQ9NY61 DVL1-203ENST00000472445 639 ntTSL 222.07■■□□□ 1.127e-7■■■■■ 40.6
AATFQ9NY61 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.481e-323■■■■■ 40.2
AATFQ9NY61 GAK-209ENST00000507580 468 ntTSL 425.77■■□□□ 1.727e-7■■■■■ 40
AATFQ9NY61 GAK-219ENST00000512325 577 ntTSL 325.77■■□□□ 1.727e-7■■■■■ 40
AATFQ9NY61 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 525.47■■□□□ 1.677e-7■■■■■ 40
AATFQ9NY61 GAK-202ENST00000502656 554 ntTSL 423.7■■□□□ 1.387e-7■■■■■ 40
AATFQ9NY61 GAK-212ENST00000510022 618 ntTSL 411.35□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 40
AATFQ9NY61 GAK-215ENST00000511229 568 ntTSL 36.87□□□□□ -1.317e-7■■■■■ 40
AATFQ9NY61 TMEM107-205ENST00000449985 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.111e-323■■■■■ 39.9
AATFQ9NY61 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.2□□□□□ -2.381e-323■■■■■ 39.9
AATFQ9NY61 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 39.7
AATFQ9NY61 TNPO2-212ENST00000588491 737 ntTSL 519.71■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 TNPO2-215ENST00000589572 586 ntTSL 314.26□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 228.12■■■□□ 2.094e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 328.12■■■□□ 2.094e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.054e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-212ENST00000525695 907 ntTSL 527.46■■□□□ 1.994e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.984e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.834e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-216ENST00000526710 996 ntTSL 225.07■■□□□ 1.64e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.444e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.434e-6■■■■■ 39.5
Retrieved 100 of 5,565 protein–RNA pairs in 36.9 ms