Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY37

ASIC5, Acid-sensing ion channel 5, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC5Q9NY37 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC5Q9NY37 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC5Q9NY37 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC5Q9NY37 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC5Q9NY37 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC5Q9NY37 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC5Q9NY37 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC5Q9NY37 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC5Q9NY37 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC5Q9NY37 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC5Q9NY37 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC5Q9NY37 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC5Q9NY37 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC5Q9NY37 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC5Q9NY37 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC5Q9NY37 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms