Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX43Q9NXZ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX43Q9NXZ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms