Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKS1Q9NXB0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKS1Q9NXB0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKS1Q9NXB0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKS1Q9NXB0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms