Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVK13-1Q9NX77 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVK13-1Q9NX77 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms