Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXD2Q9NVH0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXD2Q9NVH0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXD2Q9NVH0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EXD2Q9NVH0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXD2Q9NVH0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms