Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF19AQ9NV58 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF19AQ9NV58 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF19AQ9NV58 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms