Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK0

KLC4, Kinesin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC4Q9NSK0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLC4Q9NSK0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLC4Q9NSK0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLC4Q9NSK0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLC4Q9NSK0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLC4Q9NSK0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLC4Q9NSK0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLC4Q9NSK0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLC4Q9NSK0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLC4Q9NSK0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLC4Q9NSK0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLC4Q9NSK0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLC4Q9NSK0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLC4Q9NSK0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLC4Q9NSK0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLC4Q9NSK0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLC4Q9NSK0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms