Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A13Q9NSD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A13Q9NSD5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A13Q9NSD5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms