Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD18Q9NS91 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD18Q9NS91 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms