Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP2Q9NS61 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms