Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS45Q9NRW7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS45Q9NRW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS45Q9NRW7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms