Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO4Q9NRQ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO4Q9NRQ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO4Q9NRQ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO4Q9NRQ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO4Q9NRQ5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO4Q9NRQ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO4Q9NRQ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO4Q9NRQ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO4Q9NRQ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO4Q9NRQ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms