Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NECTIN3Q9NQS3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NECTIN3Q9NQS3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms