Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIT2Q9NQR4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIT2Q9NQR4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIT2Q9NQR4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms