Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A3Q9NQ40 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC52A3Q9NQ40 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC52A3Q9NQ40 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms