Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NLRC4Q9NPP4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NLRC4Q9NPP4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRC4Q9NPP4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms