Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARFGAP3Q9NP61 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGAP3Q9NP61 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGAP3Q9NP61 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms