Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX4

TRPC7, Short transient receptor potential channel 7, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC7Q9HCX4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC7Q9HCX4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC7Q9HCX4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPC7Q9HCX4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPC7Q9HCX4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPC7Q9HCX4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRPC7Q9HCX4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC7Q9HCX4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC7Q9HCX4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPC7Q9HCX4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms