Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S4

CAB39L, Calcium-binding protein 39-like, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39LQ9H9S4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAB39LQ9H9S4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAB39LQ9H9S4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAB39LQ9H9S4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAB39LQ9H9S4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAB39LQ9H9S4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAB39LQ9H9S4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAB39LQ9H9S4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAB39LQ9H9S4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms