Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9A7

RMI1, RecQ-mediated genome instability protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMI1Q9H9A7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RMI1Q9H9A7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RMI1Q9H9A7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMI1Q9H9A7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms