Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REEP1Q9H902 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP1Q9H902 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP1Q9H902 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms