Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
C10orf88Q9H8K7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C10orf88Q9H8K7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf88Q9H8K7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms