Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPF2Q9H7B2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPF2Q9H7B2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms