Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RETREG1Q9H6L5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RETREG1Q9H6L5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RETREG1Q9H6L5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms