Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX17Q9H6I2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX17Q9H6I2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX17Q9H6I2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms