Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM38AQ9H6F2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms