Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA6BQ9H3T3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEMA6BQ9H3T3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA6BQ9H3T3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA6BQ9H3T3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms