Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF4Q9H2L5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASSF4Q9H2L5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASSF4Q9H2L5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF4Q9H2L5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms