Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP62CLQ9H1M0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP62CLQ9H1M0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP62CLQ9H1M0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP62CLQ9H1M0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NUP62CLQ9H1M0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP62CLQ9H1M0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP62CLQ9H1M0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP62CLQ9H1M0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP62CLQ9H1M0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP62CLQ9H1M0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP62CLQ9H1M0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP62CLQ9H1M0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP62CLQ9H1M0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP62CLQ9H1M0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP62CLQ9H1M0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms